SaGa Frontier 2 berupaya melakukan inovasi dari segi gameplay, meski tidak selalu berhasil.
Beberapa perubahan pertarungan sangat membantu, seperti memungkinkan pemain melawan musuh dalam pertarungan satu lawan satu; namun pertempuran strategis skala besar terasa janggal. Untungnya, pertempuran ini jarang terjadi.
Secara umum, pertarungan adalah SaGa murni: bola lampu yang berkedip dalam pertempuran berarti sesuatu bagi kalian atau tidak.
Namun, pertempuran terasa lebih mudah diakses oleh seri pendatang baru dengan kemampuan baru untuk mengeluarkan Life Points (LP) dalam pertempuran untuk mendapatkan penyembuhan penuh.
Saya pribadi menganggap kedua game SaGa Frontier sebagai seri poin tertinggi, mewakili yang terbaik dalam hal cerita, pertarungan, dan presentasi, dengan cara yang belum pernah ada tandingannya sejak saat itu. Isi ceritanya bisa sangat mempengaruhi, dan eksekusinya aneh serta mengasyikkan.
Mungkin karena ceritanya lebih kohesif pada awalnya, SaGa Frontier 2 mampu mencapai tingkat emosi tertinggi yang tidak dimiliki Frontier.